64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4023 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4023  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 		 635 aa  1311    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.0865565 
 
 
-
 
NC_002620  TC0666  hypothetical protein  30.88 
 
 		 696 aa  91.3  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0578276  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  28 
 
 		 240 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  30.11 
 
 		 270 aa  53.9  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  29.21 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  29.01 
 
 		 216 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  26.63 
 
 		 252 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  26.63 
 
 		 252 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  26.63 
 
 		 252 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  27.07 
 
 		 252 aa  51.2  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 249 aa  51.2  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  26.49 
 
 		 252 aa  50.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 249 aa  50.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 249 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 244 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 244 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  27.62 
 
 		 244 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 244 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 244 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  30.37 
 
 		 317 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  26.63 
 
 		 252 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  31.1 
 
 		 317 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  30.97 
 
 		 239 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  26.63 
 
 		 252 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  26.85 
 
 		 245 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  27.22 
 
 		 229 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  29.21 
 
 		 243 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  30.49 
 
 		 317 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  29.12 
 
 		 239 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  27.87 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  26.9 
 
 		 261 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  25.16 
 
 		 239 aa  48.5  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  30.5 
 
 		 332 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  31.93 
 
 		 241 aa  47.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  28.67 
 
 		 263 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  28.73 
 
 		 273 aa  47.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  29.29 
 
 		 283 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6766  hypothetical protein  35.37 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  27.46 
 
 		 266 aa  47  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.33 
 
 		 245 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  28.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  27.66 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  25.68 
 
 		 247 aa  46.2  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  26.55 
 
 		 241 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  23.57 
 
 		 245 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  25.49 
 
 		 242 aa  46.6  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  27.97 
 
 		 247 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  30.14 
 
 		 263 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3209  hypothetical protein  33.72 
 
 		 178 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.228395  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  26.14 
 
 		 260 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  27.57 
 
 		 283 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  26.45 
 
 		 247 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  31.07 
 
 		 216 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  28.77 
 
 		 268 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  31.94 
 
 		 279 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  28.29 
 
 		 289 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  29.22 
 
 		 287 aa  44.3  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  27.27 
 
 		 313 aa  44.3  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  27.63 
 
 		 287 aa  44.3  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0091  lysine decarboxylase family protein  33.64 
 
 		 201 aa  43.9  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  30.57 
 
 		 280 aa  43.9  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  26.03 
 
 		 218 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>