27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3060 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  306  9e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2985  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.22 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171008  normal  0.0376623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  35.29 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 172 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  31.76 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3504  cyclic nucleotide-binding protein  36.9 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  45.1 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  28.45 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  34.57 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  28.38 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  32.76 
 
 		 163 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  32.48 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  29.73 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  27.5 
 
 		 119 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 172 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>