More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2366 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2366  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
168 aa  348  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  37.67 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3069  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 
171 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.0281827 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  39.42 
 
 
151 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  36.5 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  36.5 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  29.79 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  26.47 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
139 aa  60.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  27.61 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  31.94 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 
143 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  33.64 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 
136 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
143 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
143 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 
138 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 
134 aa  58.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  33.08 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  31.58 
 
 
145 aa  57.8  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  33.68 
 
 
139 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  30.56 
 
 
159 aa  57.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  32.33 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  31.58 
 
 
155 aa  57.4  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  30.08 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  32.33 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  32.33 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  32.33 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.99 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  28.38 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  32.33 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  32.33 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  32.33 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  32.33 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  29.73 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  32.31 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  31.54 
 
 
134 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  29.5 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  31.5 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.38 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  29.17 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.38 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.38 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  29.17 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  26.21 
 
 
146 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  32.43 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  28.8 
 
 
129 aa  55.1  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.38 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.38 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.38 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  29.25 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  41.77 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.38 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.34 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  34.02 
 
 
161 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  27.61 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 
148 aa  54.7  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  29.2 
 
 
145 aa  54.7  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  29.1 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2073  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  30.91 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  29.41 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 
140 aa  54.3  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  29.32 
 
 
143 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  27.46 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  35.48 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0127  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  27.46 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  31.53 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1568  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.31 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  29.55 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>