22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2569 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2569  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2323  hypothetical protein  53.62 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21790  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  52.94 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  45.45 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2905  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1685  hypothetical protein  41 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1415  hypothetical protein  43.28 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2240  hypothetical protein  43.14 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0381986  decreased coverage  0.0061856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1163  hypothetical protein  38.78 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.538516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1871  hypothetical protein  41.79 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.086654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2273  hypothetical protein  37.78 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000150723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11570  hypothetical protein  37.96 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.875701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5943  hypothetical protein  38.3 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0607737  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  39.68 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1945  hypothetical protein  45.95 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  35.06 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  35.06 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2298  integral membrane protein  37.66 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  33.98 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  33.01 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  34.78 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>