18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2266 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  80.39 
 
 
255 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  36.36 
 
 
353 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  32.97 
 
 
282 aa  99.4  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  37.12 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  30.95 
 
 
352 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  32.82 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  25.97 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  36.56 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  38.54 
 
 
407 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  32.69 
 
 
352 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  30.47 
 
 
348 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  34.95 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  30.47 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  30.47 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  34.91 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  35.58 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  28.28 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>