More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1364 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
480 aa  965    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  58.56 
 
 
492 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  55.51 
 
 
501 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  56.24 
 
 
492 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  56.13 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  52.43 
 
 
479 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  51.5 
 
 
627 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  53.15 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  53.03 
 
 
539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  50.88 
 
 
513 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  50.99 
 
 
522 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  51.07 
 
 
485 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  46.92 
 
 
531 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  47.37 
 
 
530 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  47.37 
 
 
517 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  49.16 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  49.16 
 
 
515 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  49.26 
 
 
531 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  49.49 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  47.16 
 
 
500 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  47.98 
 
 
521 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  47.16 
 
 
500 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  50.85 
 
 
506 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  48.99 
 
 
532 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  41.44 
 
 
531 aa  371  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  43.09 
 
 
531 aa  372  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  42.32 
 
 
453 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  38.44 
 
 
446 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  38.44 
 
 
446 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  35.51 
 
 
436 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  34.49 
 
 
434 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  35.28 
 
 
436 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  34.37 
 
 
443 aa  216  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  37.59 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  33.48 
 
 
439 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  36.21 
 
 
445 aa  209  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  34.99 
 
 
435 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  33.93 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  37.58 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  33.26 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  34.44 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  33.77 
 
 
454 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  33.77 
 
 
439 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  36.36 
 
 
442 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  33.85 
 
 
439 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  35.78 
 
 
436 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  34.08 
 
 
454 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  36 
 
 
439 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  37.28 
 
 
439 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  31.83 
 
 
461 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  32.23 
 
 
441 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  37.36 
 
 
439 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  34.4 
 
 
464 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  31.22 
 
 
439 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  35.92 
 
 
442 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  31.94 
 
 
444 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  33.41 
 
 
461 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  33.48 
 
 
464 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  33.69 
 
 
473 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  30.87 
 
 
444 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  35.56 
 
 
437 aa  190  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  31.15 
 
 
444 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  34.02 
 
 
461 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  33.11 
 
 
464 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  32.46 
 
 
443 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  37.39 
 
 
446 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  31.25 
 
 
441 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  33.26 
 
 
439 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16321  putative aminopeptidase P  31.83 
 
 
441 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16441  putative aminopeptidase P  31.67 
 
 
441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.689084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  32.21 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  33.91 
 
 
474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  31 
 
 
436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  32.52 
 
 
436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  33.02 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  30.33 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  32.07 
 
 
437 aa  183  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  32.29 
 
 
436 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  30.97 
 
 
444 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  31.09 
 
 
444 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.95 
 
 
441 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  31.09 
 
 
444 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  33.55 
 
 
465 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  33.56 
 
 
461 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  33.56 
 
 
461 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  32.07 
 
 
438 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  34.09 
 
 
452 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  35.21 
 
 
433 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  32.07 
 
 
438 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  33.26 
 
 
449 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  32.9 
 
 
462 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  33.56 
 
 
461 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.05 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  30.92 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  33.41 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  31.72 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  36.12 
 
 
441 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  31.09 
 
 
444 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  31.85 
 
 
438 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  31.85 
 
 
438 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>