35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0646 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  958    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  36.49 
 
 
513 aa  309  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  36.36 
 
 
505 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  36.46 
 
 
498 aa  279  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  36.46 
 
 
498 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  37.76 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  35.43 
 
 
504 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  37.07 
 
 
498 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  36.98 
 
 
476 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  36.98 
 
 
476 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  35.99 
 
 
466 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  37.14 
 
 
472 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  36.91 
 
 
472 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  37.21 
 
 
468 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  36.33 
 
 
469 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  36.53 
 
 
494 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  37.24 
 
 
469 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  34.94 
 
 
502 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  38.16 
 
 
472 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  34.34 
 
 
502 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  36.16 
 
 
489 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  34.83 
 
 
491 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  33.87 
 
 
495 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  36.77 
 
 
477 aa  256  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  34.24 
 
 
473 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  36.07 
 
 
477 aa  249  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  36.44 
 
 
477 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  34.48 
 
 
494 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  32.28 
 
 
501 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  35.43 
 
 
484 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  34.76 
 
 
498 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  32.89 
 
 
501 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  34.27 
 
 
437 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  25.42 
 
 
419 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  25.42 
 
 
419 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>