19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1390 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  753    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0647  hypothetical protein  63.53 
 
 
377 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3034  hypothetical protein  54.84 
 
 
371 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3253  hypothetical protein  43.02 
 
 
385 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1897  hypothetical protein  43.03 
 
 
361 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000359391  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5340  hypothetical protein  40.71 
 
 
361 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4851  NHL repeat-containing protein  38.36 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0728414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4334  hypothetical protein  37.74 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  normal  0.0216853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5305  hypothetical protein  38.44 
 
 
391 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0275218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0789  hypothetical protein  39.66 
 
 
374 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6608  hypothetical protein  40.65 
 
 
390 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1294  hypothetical protein  38.4 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1386  hypothetical protein  35.63 
 
 
361 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.473067  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0927  hypothetical protein  29.4 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  70.37 
 
 
202 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  48 
 
 
201 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  58.06 
 
 
297 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  48.08 
 
 
239 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  54.55 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>