20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1636 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1636  Rhomboid family protein  100 
 
 		 216 aa  423  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  32.57 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  32.33 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  34.74 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  33.18 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0158  Rhomboid family protein  33.69 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  28.57 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  30.11 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  28 
 
 		 554 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  26.21 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  29.9 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  29.9 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  27.21 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  29.9 
 
 		 172 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  33.75 
 
 		 186 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  24.64 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  29.03 
 
 		 236 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  26.09 
 
 		 293 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>