70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4001 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
211 aa  420  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.371815  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
496 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
496 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
496 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4225  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.62 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  36.79 
 
 
268 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.86 
 
 
497 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.84 
 
 
499 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.1 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.45 
 
 
305 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.19 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  30.23 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0196  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.32 
 
 
490 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  30.23 
 
 
255 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.61 
 
 
252 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  31.63 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3916  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.07 
 
 
498 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.51 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257956  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.21 
 
 
489 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0393  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.51 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0402  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.51 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.44 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.82 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.01 
 
 
497 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  30.61 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.92 
 
 
311 aa  48.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.15 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3179  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.33 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.57 
 
 
360 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.43 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.43 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.97 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.67 
 
 
179 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1375  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.62 
 
 
273 aa  45.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.4 
 
 
252 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.52 
 
 
249 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.5 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0831  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.38 
 
 
157 aa  45.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.14 
 
 
199 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.32 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.58 
 
 
249 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.68 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0756  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.65 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.91 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.78 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.47 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.36 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.68 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.63 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.26 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0429  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.82 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.402808  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  28.15 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.31 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.13 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  39.47 
 
 
138 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  29.1 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1230  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.67 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.31 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0450  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.66 
 
 
178 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4462  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.45 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0262508  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  29.52 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.45 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4399  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.93 
 
 
229 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  28.83 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  28.44 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.69 
 
 
185 aa  41.6  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.9 
 
 
263 aa  41.2  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.19 
 
 
200 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>