23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0694 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 525 aa  1011    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  50.56 
 
 		 528 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  71.23 
 
 		 534 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  53.97 
 
 		 526 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  70.71 
 
 		 542 aa  206  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  49.62 
 
 		 525 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  59.88 
 
 		 532 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  48.97 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  41.73 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  53.54 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  49.44 
 
 		 526 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 641 aa  97.8  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  49 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  49 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  50 
 
 		 607 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  38.27 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  28.43 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  27.64 
 
 		 674 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  35.14 
 
 		 778 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  35.05 
 
 		 525 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  35.05 
 
 		 525 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  27.19 
 
 		 686 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2434  flagellar hook-length control protein  39.24 
 
 		 693 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>