34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0234 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  263  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  71.74 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  68.35 
 
 		 139 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  69.06 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  68.35 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  52.67 
 
 		 148 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  48.18 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  47.45 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  62.1 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  72.62 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  58.06 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  74.03 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  58.2 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  57.38 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  57.38 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  55.4 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  53.96 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  47.89 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  40.58 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  61.45 
 
 		 137 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  50.68 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  50.68 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  49.23 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  47.69 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  49.25 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  34.15 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  38.26 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  37.76 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  46.27 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  35.04 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  44.57 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  38.46 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>