29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5416 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  100 
 
 		 345 aa  680    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  51.59 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  61.09 
 
 		 309 aa  315  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  55.7 
 
 		 312 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  32.54 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  29.59 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  32.54 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  30.5 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  28.48 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  45.56 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  30.25 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  38.38 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  29.08 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  37.23 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  33.11 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  32.41 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  39.64 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  24.22 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  28.99 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  32.88 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  30.57 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  31.58 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4640  abortive infection protein  41.98 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  32.67 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  33.04 
 
 		 275 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  30.11 
 
 		 203 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  30.11 
 
 		 203 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  30.11 
 
 		 203 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  30.11 
 
 		 203 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>