52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3939 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  37.16 
 
 
186 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  35.87 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
239 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  31.35 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  30.18 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8040  hypothetical protein  35.23 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  43.75 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  36.65 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  26.2 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  29.41 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  28.25 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  35.25 
 
 
257 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  26.25 
 
 
202 aa  51.6  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  29.3 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1615  protein of unknown function DUF820  28.93 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  31.62 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
197 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  26.78 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  28.73 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2429  protein of unknown function DUF820  28.68 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  30.71 
 
 
182 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  32 
 
 
185 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  30.27 
 
 
251 aa  44.7  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  28.8 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  33.59 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.71 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  30.15 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  28.48 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  30.12 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  28.41 
 
 
224 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  28.93 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.17 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  28.17 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  28 
 
 
184 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  32.28 
 
 
201 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  26.01 
 
 
203 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  27.63 
 
 
192 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  33.61 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  27.04 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
184 aa  42  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  32.91 
 
 
126 aa  41.6  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  31.4 
 
 
183 aa  41.2  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  30.54 
 
 
188 aa  41.6  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  29.46 
 
 
202 aa  41.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>