19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4404 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4404  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  521  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  38.71 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  38.38 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0285  twin-arginine translocation pathway signal  38.32 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  33.19 
 
 		 348 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  35.09 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  34.06 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  50.54 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0182  hypothetical protein  35.71 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  30.81 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  28.21 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  26.6 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  32.61 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1350  hypothetical protein  32.94 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1331  hypothetical protein  32.94 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1314  hypothetical protein  32.94 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.735762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  28.68 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  29.44 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>