15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4227 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4227  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.298131  normal  0.491791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 1989 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  44.94 
 
 		 3921 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  42.27 
 
 		 726 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  46.34 
 
 		 907 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  42.7 
 
 		 2573 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  36.84 
 
 		 1293 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  40.74 
 
 		 826 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  33.72 
 
 		 587 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  33.75 
 
 		 983 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1227 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  48.21 
 
 		 3191 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1059 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1038 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  40 
 
 		 1332 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>