20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4135 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
133 aa  246  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  68.25 
 
 
143 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  52.27 
 
 
170 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  50.79 
 
 
183 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  51.18 
 
 
142 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  53.91 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  48.57 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  46.56 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  56.73 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  50.89 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  52.17 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  57.73 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  54.55 
 
 
169 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  48.09 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  41.24 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  35 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  35.44 
 
 
197 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  42.17 
 
 
508 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  49.12 
 
 
505 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  39.74 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>