34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3724 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3724  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  699    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2199  hypothetical protein  37.11 
 
 		 235 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334816  decreased coverage  0.000451545 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4298  putative recombinase  32.49 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2751  hypothetical protein  31.62 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000220273  normal  0.0224901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4712  hypothetical protein  31 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  31.94 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  29.9 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  27.27 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  36.18 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4713  hypothetical protein  28.21 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  36.55 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  30.72 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  27.39 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  28.08 
 
 		 394 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  25.77 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  26.67 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  29.22 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  30.99 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  26.12 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  23.93 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  40.79 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  51.43 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  40.79 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  23.87 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  23.6 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  32.7 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  26.75 
 
 		 649 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  25.56 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>