25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3158 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  390  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  48 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  35.42 
 
 		 249 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  43.69 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  45.12 
 
 		 314 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  44.24 
 
 		 369 aa  92.8  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  38.69 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  49.3 
 
 		 285 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  41.5 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  42.76 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  43.07 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  40.23 
 
 		 317 aa  85.1  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15760  hypothetical protein  44.38 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0643292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0922  hypothetical protein  41.89 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  44.54 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1201  hypothetical protein  39.19 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  39.66 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1191  hypothetical protein  39.19 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1174  hypothetical protein  39.19 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  34.5 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  29.45 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8989  hypothetical protein  41.35 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1439  hypothetical protein  47.43 
 
 		 246 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  37.89 
 
 		 352 aa  42  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  34.58 
 
 		 347 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>