More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3040 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3040  Integrase catalytic region  100 
 
 		 421 aa  840    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000772165  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  70.12 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  70.12 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  70.12 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  70.12 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  70.12 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  70.12 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  69.63 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12957  transposase  59.66 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0482  integrase catalytic subunit  59.27 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1024  Integrase catalytic region  51.54 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.669349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2579  Integrase catalytic region  48.79 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3900  integrase catalytic subunit  48.51 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3601  Integrase catalytic region  51.25 
 
 		 407 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000351603  normal  0.0699896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3701  Integrase catalytic region  51.25 
 
 		 407 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25730  integrase family protein  51.51 
 
 		 333 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2245  IS1533 transposase  61.54 
 
 		 264 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0270795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13668  transposase  57.76 
 
 		 166 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0360997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0578  integrase, catalytic region  57.04 
 
 		 145 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13667  transposase  57.89 
 
 		 115 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0362763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  30.73 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  32.38 
 
 		 338 aa  123  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  30.73 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  30.17 
 
 		 489 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  30.61 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  30.75 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  32.18 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  30.46 
 
 		 340 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  30 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  29.72 
 
 		 491 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  29.72 
 
 		 491 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  31.05 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  31.36 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  30.79 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  30.79 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  30.79 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  30.85 
 
 		 496 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  30.53 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  30.53 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  30.53 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  30.97 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  31.1 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  30.97 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 502 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0356  integrase catalytic region  32.25 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  30.96 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  30.96 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  30.96 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  30.96 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  30.96 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  30.96 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  30.96 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  30.96 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>