More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1175 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1175  sulphate transporter  100 
 
 
625 aa  1206    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0877233  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3236  sulphate transporter  44.3 
 
 
562 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  36.97 
 
 
549 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  27.63 
 
 
573 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  26.41 
 
 
580 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  31.38 
 
 
730 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  31.59 
 
 
729 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  32.23 
 
 
711 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  26.05 
 
 
626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  29.85 
 
 
584 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  28.98 
 
 
496 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  29.02 
 
 
603 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  29.79 
 
 
703 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  27.44 
 
 
577 aa  151  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  31.03 
 
 
571 aa  150  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02670  hypothetical protein  26.79 
 
 
496 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  24.49 
 
 
605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  28.12 
 
 
575 aa  148  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  28.78 
 
 
502 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  26.26 
 
 
568 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  25.26 
 
 
620 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  31.8 
 
 
575 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  31.69 
 
 
603 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6130  sulfate transporter  33.1 
 
 
563 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0582115 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  28.6 
 
 
577 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  31.98 
 
 
711 aa  143  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.03 
 
 
570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  29.35 
 
 
499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  29.83 
 
 
494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  31.5 
 
 
588 aa  141  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  28.22 
 
 
586 aa  141  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  29.33 
 
 
499 aa  141  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  30.26 
 
 
484 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  28.67 
 
 
608 aa  141  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  29.89 
 
 
590 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  28.9 
 
 
492 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  28.9 
 
 
492 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  27.14 
 
 
565 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  28.84 
 
 
588 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  28.15 
 
 
703 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  25.91 
 
 
587 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  26.15 
 
 
583 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  28.4 
 
 
500 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  29.06 
 
 
499 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  27.46 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  27.44 
 
 
572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31380  putative sulfate transporter  30.3 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114535  hitchhiker  0.000000000000146923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  29.92 
 
 
495 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3083  sulphate transporter  32.39 
 
 
498 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0982983  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  30.32 
 
 
496 aa  135  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  24.8 
 
 
568 aa  135  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.36 
 
 
599 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  28.44 
 
 
502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3234  sulfate permease family protein  30.79 
 
 
495 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  29.73 
 
 
590 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  28.06 
 
 
495 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  27.33 
 
 
560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  32.3 
 
 
604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3926  sulphate transporter  28.95 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0884886  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  27.4 
 
 
572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  27.93 
 
 
496 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  30.15 
 
 
583 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  28.92 
 
 
495 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.64 
 
 
578 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1646  sulphate transporter  29.27 
 
 
527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0415983  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  28.44 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  29.34 
 
 
496 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3086  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  31.05 
 
 
495 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  27.62 
 
 
495 aa  130  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1631  sulphate transporter  29.24 
 
 
499 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  24.71 
 
 
552 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  28.3 
 
 
551 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1049  sulphate transporter  30.88 
 
 
500 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.000191113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  31.68 
 
 
556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  29.03 
 
 
604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3487  sulphate transporter  30.6 
 
 
496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  26.15 
 
 
559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1878  sulphate transporter  30.83 
 
 
572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.536686  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  29.39 
 
 
599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  29.02 
 
 
496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  26.2 
 
 
568 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  26.02 
 
 
483 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  32.31 
 
 
501 aa  128  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  26.88 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  26.88 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  26.88 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  26.88 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  26.88 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  26.88 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  24.83 
 
 
487 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  28.3 
 
 
496 aa  127  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  26.88 
 
 
570 aa  127  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  28.38 
 
 
506 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  28.23 
 
 
555 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  27.76 
 
 
496 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  26.16 
 
 
553 aa  126  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  28.09 
 
 
564 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  27.37 
 
 
492 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21570  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  30.71 
 
 
505 aa  125  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  26.29 
 
 
483 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>