24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0730 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  100 
 
 		 270 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  36.26 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  35.65 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  31.69 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  39.66 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  32.97 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  34.34 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  37.36 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  41.35 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  43.59 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  41.41 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  40.78 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  28.79 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  38.54 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  37 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  53.12 
 
 		 448 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  34.95 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  41.57 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  42.42 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  31.53 
 
 		 242 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>