More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0483 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  70.71 
 
 
679 aa  922    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  100 
 
 
679 aa  1379    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  58.14 
 
 
682 aa  765    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  65.05 
 
 
680 aa  898    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  53.77 
 
 
714 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  57.29 
 
 
704 aa  785    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  59.71 
 
 
692 aa  811    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  53.29 
 
 
802 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  70.8 
 
 
678 aa  949    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  65.1 
 
 
680 aa  898    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  56.28 
 
 
685 aa  718    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  66.52 
 
 
684 aa  891    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  67.75 
 
 
690 aa  922    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  71.15 
 
 
679 aa  960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  55.51 
 
 
716 aa  741    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  67.26 
 
 
690 aa  910    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  67.31 
 
 
690 aa  916    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  60.82 
 
 
683 aa  818    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  65.1 
 
 
680 aa  898    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  63.69 
 
 
681 aa  846    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  67.94 
 
 
686 aa  889    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.24 
 
 
682 aa  857    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  55.29 
 
 
678 aa  719    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  60.26 
 
 
691 aa  807    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  55.07 
 
 
689 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  68.59 
 
 
699 aa  914    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  69.08 
 
 
680 aa  941    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  60 
 
 
686 aa  820    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  66.62 
 
 
681 aa  917    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  65.1 
 
 
680 aa  898    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  66.52 
 
 
680 aa  910    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  61.96 
 
 
687 aa  837    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  65.54 
 
 
738 aa  892    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  44.44 
 
 
642 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  45.97 
 
 
652 aa  544  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  43.82 
 
 
645 aa  534  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  42.28 
 
 
647 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  40.45 
 
 
635 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  40.61 
 
 
635 aa  492  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  66.03 
 
 
846 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  40.98 
 
 
647 aa  478  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  42.24 
 
 
676 aa  475  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  41.01 
 
 
644 aa  439  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  33.53 
 
 
650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  31.72 
 
 
600 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  32.51 
 
 
587 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.37 
 
 
566 aa  187  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.72 
 
 
566 aa  181  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.36 
 
 
566 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  29.21 
 
 
576 aa  176  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  29.21 
 
 
576 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.15 
 
 
577 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.66 
 
 
573 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  30.91 
 
 
554 aa  169  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.08 
 
 
583 aa  168  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  30.4 
 
 
599 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.5 
 
 
571 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  29.93 
 
 
591 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  27.56 
 
 
575 aa  159  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  29.96 
 
 
584 aa  158  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.04 
 
 
577 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.11 
 
 
597 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  29.87 
 
 
598 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  26.33 
 
 
574 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  27.01 
 
 
582 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  27.77 
 
 
611 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  29.45 
 
 
543 aa  150  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  29 
 
 
553 aa  150  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.36 
 
 
542 aa  150  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.36 
 
 
542 aa  150  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  28.35 
 
 
556 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  27.94 
 
 
559 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  29.09 
 
 
577 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  28.27 
 
 
566 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  25.04 
 
 
543 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  28.27 
 
 
552 aa  144  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  29.93 
 
 
571 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  27.56 
 
 
590 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  27.45 
 
 
545 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.53 
 
 
577 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  27.02 
 
 
552 aa  140  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  28.74 
 
 
561 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  27.73 
 
 
586 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  28.1 
 
 
564 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  29.23 
 
 
539 aa  138  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  27.68 
 
 
556 aa  137  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  28.71 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  28.46 
 
 
567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  28.11 
 
 
583 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  26.75 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.71 
 
 
591 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  28.65 
 
 
567 aa  134  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  26.2 
 
 
700 aa  133  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  29 
 
 
585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  27.92 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.8 
 
 
658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  25.99 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  26.29 
 
 
545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  27.6 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  29.37 
 
 
550 aa  132  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>