35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0809 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0809  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.770269  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.893816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0004  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0055  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.763699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0090  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0007  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0003  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0491  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0029  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0120  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0536302  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0058  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.11838  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0032  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.101826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000131099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000528096  normal  0.244498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102634  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.032059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0065  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t28  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122448  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t05  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>