264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1743 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1743  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
57 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884753  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4720  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  92.86 
 
 
57 aa  110  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  74.07 
 
 
55 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  77.36 
 
 
53 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  72.92 
 
 
470 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  77.36 
 
 
53 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  77.36 
 
 
53 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5738  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  76.47 
 
 
54 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2749  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.81 
 
 
53 aa  86.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  68.75 
 
 
481 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0442  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.059171  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
172 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5440  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.41 
 
 
72 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366792  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0603  hypothetical protein  60.78 
 
 
63 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.09 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.79 
 
 
55 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  50.98 
 
 
477 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  47.27 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  47.27 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  49.09 
 
 
55 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  52.38 
 
 
589 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  49.09 
 
 
55 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.27 
 
 
54 aa  57  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.98 
 
 
54 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  44 
 
 
479 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
444 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  44 
 
 
479 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  44 
 
 
479 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  47.06 
 
 
461 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  44 
 
 
479 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  50 
 
 
60 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
444 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  42 
 
 
479 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  42 
 
 
479 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  42 
 
 
479 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  56.25 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  42 
 
 
479 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.55 
 
 
54 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  42 
 
 
479 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3191  rubredoxin  50 
 
 
50 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423634  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  46.15 
 
 
58 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  47.27 
 
 
56 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
55 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  42.86 
 
 
500 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
444 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  43.64 
 
 
55 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
54 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
415 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.02 
 
 
56 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
56 aa  53.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
469 aa  53.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.92 
 
 
476 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  45.28 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  49.02 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
54 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.15 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1780  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.322429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.07 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1851  rubredoxin  47.17 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  38 
 
 
229 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 
445 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2748  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.3 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1744  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.15 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
55 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.3 
 
 
60 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
57 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
58 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  40.91 
 
 
494 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.58 
 
 
591 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
56 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
52 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  43.18 
 
 
485 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
55 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  40.91 
 
 
479 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.82 
 
 
480 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
52 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  43.48 
 
 
499 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.3 
 
 
221 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.82 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  45.28 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  40.91 
 
 
482 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  44.19 
 
 
504 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.51 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1311  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>