63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0410 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  83.22 
 
 
301 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  73.51 
 
 
303 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  73.51 
 
 
303 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  73.51 
 
 
303 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  64.95 
 
 
306 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  59.64 
 
 
284 aa  299  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  49.06 
 
 
272 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  49.82 
 
 
271 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  48.89 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  46.79 
 
 
277 aa  225  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  45.67 
 
 
342 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  47.03 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  47.76 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  47.76 
 
 
343 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  47.76 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  43.82 
 
 
315 aa  211  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  38.6 
 
 
319 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  38.17 
 
 
257 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  38.71 
 
 
282 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  37.55 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  35.07 
 
 
261 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  31.2 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  35.06 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  31.08 
 
 
285 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  28.91 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  27.89 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  29.26 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  30.77 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  29.2 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  23.97 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  23.97 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  23.97 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  28.05 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  27.49 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  25.51 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  25.63 
 
 
312 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  21.62 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  22.9 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  25.59 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  26.14 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  25.98 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  27.53 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  25.19 
 
 
267 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  26.7 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  23.02 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  23.2 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  26.67 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  22.67 
 
 
351 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  24.55 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  26.19 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  26.67 
 
 
364 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  21.15 
 
 
351 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10481  conserved hypothetical protein  22.47 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00162641  normal  0.337442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  21.15 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  21.15 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  20.75 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  26.72 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  26.59 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  23.98 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  20.24 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>