20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1310 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  202  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  56.04 
 
 
1122 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  57.33 
 
 
1115 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  48.78 
 
 
1109 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  39.77 
 
 
1137 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  42.86 
 
 
1109 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  40.79 
 
 
959 aa  59.3  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  39.47 
 
 
948 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  44.59 
 
 
950 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  36.84 
 
 
949 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  40.3 
 
 
1099 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  33.68 
 
 
942 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.42 
 
 
1108 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  31.03 
 
 
936 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  37.18 
 
 
1098 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  33.33 
 
 
941 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  32.63 
 
 
1098 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  33.71 
 
 
1098 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  32.58 
 
 
1094 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  29.33 
 
 
945 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>