36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3880 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  100 
 
 		 409 aa  829    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  43.55 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  40.3 
 
 		 474 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  40.73 
 
 		 485 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  39.82 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  40.12 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  40.12 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  37.6 
 
 		 481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  35.97 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  35.86 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  34.56 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  35.2 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  32.06 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  35.06 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  33.17 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  33.04 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  33.55 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  38.39 
 
 		 539 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  39.21 
 
 		 540 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  37.05 
 
 		 538 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  39.65 
 
 		 600 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  36.68 
 
 		 547 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  40.09 
 
 		 565 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  39.74 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  31.11 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  30.96 
 
 		 299 aa  97.1  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0016  hypothetical protein  28.23 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0817  hypothetical protein  32.71 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  26.19 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  25.38 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1336  hypothetical protein  23.65 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00372863  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  25.38 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4626  GDSL family lipase  28.72 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  24.87 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3912  hypothetical protein  28 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1301  hypothetical protein  28.7 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>