25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3059 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  616  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  50.42 
 
 		 455 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  43.55 
 
 		 336 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  48.28 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  48.28 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  42.5 
 
 		 433 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  42.5 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  37.24 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  37.24 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  37.24 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  37.24 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  40.38 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  44.57 
 
 		 640 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  43.16 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  35.77 
 
 		 608 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  43.01 
 
 		 611 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  43.53 
 
 		 423 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  38.04 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  38.82 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  32.26 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  34.07 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  34.07 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  33.02 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  32.54 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2723  hypothetical protein  44.23 
 
 		 192 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.00000000361112  normal  0.12899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>