18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1321 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  721    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  49.15 
 
 		 382 aa  279  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  30.73 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  33.04 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  34.51 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  31.02 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  28.87 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  28.15 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  26.35 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  29.53 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  29.67 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  32.11 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 		 523 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  27.7 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  30.43 
 
 		 1089 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  25.7 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0884  hypothetical protein  28.09 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.45645  normal  0.0146816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1231 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>