21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0932 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  56.38 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  46.67 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  45 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  45 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  42.64 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  45.83 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  38.16 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  45.83 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  43.85 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  44.26 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  38.4 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  35.43 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  41.12 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  35.4 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.52 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  32.86 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  32.29 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  35.48 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  31.53 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>