31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2082 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  55.39 
 
 		 609 aa  712    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  100 
 
 		 600 aa  1221    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.901274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1296  AAA ATPase  26.92 
 
 		 537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0819436 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  27.72 
 
 		 521 aa  167  8e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1108  AAA ATPase  29.15 
 
 		 534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00107728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1145  AAA ATPase  27.8 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00264126  hitchhiker  0.0000264348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1512  AAA ATPase  32.18 
 
 		 595 aa  101  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000264338  normal  0.723812 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.21 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  29.31 
 
 		 783 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  22.47 
 
 		 539 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  22.07 
 
 		 605 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1658  hypothetical protein  21.28 
 
 		 604 aa  51.2  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  28.8 
 
 		 604 aa  50.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  26.5 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3982  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  36.07 
 
 		 776 aa  47.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  26.05 
 
 		 625 aa  47  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.49 
 
 		 608 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  23.14 
 
 		 523 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  25.76 
 
 		 643 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.86 
 
 		 611 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  33.66 
 
 		 526 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  27.27 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.96 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  27.27 
 
 		 513 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  27.27 
 
 		 511 aa  45.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5160  hypothetical protein  30.1 
 
 		 768 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  32.69 
 
 		 523 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  42.11 
 
 		 701 aa  44.3  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  28.03 
 
 		 511 aa  44.3  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  29.46 
 
 		 581 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  25.21 
 
 		 653 aa  43.5  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>