88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1110 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1110  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
407 aa  826    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.48551  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1514  transposase, IS605 OrfB family  79.17 
 
 
404 aa  655    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2717  transposase, IS605 OrfB family  79.17 
 
 
404 aa  655    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119392  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2771  transposase, IS605 OrfB family  79.41 
 
 
406 aa  664    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.680266  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0841  IS605 family transposase OrfB  44.79 
 
 
431 aa  319  6e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.084899  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0134  IS605 family transposase OrfB  38.79 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1907  IS605 family transposase OrfB  39.65 
 
 
433 aa  269  8e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128172  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1067  IS605 family transposase OrfB  38.4 
 
 
416 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  27.37 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  28.23 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  26.51 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  24.74 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  23.92 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2047  transposase, IS605 OrfB family  26.77 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0187129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2151  transposase, IS605 OrfB family  26.46 
 
 
422 aa  60.1  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0894  transposase, IS605 OrfB family  25.9 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.673703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0912  transposase, IS605 OrfB family  25.46 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  27.97 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  27.54 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2444  transposase, IS605 OrfB family  25.85 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  27.38 
 
 
360 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3136  transposase, IS605 OrfB family  27.3 
 
 
360 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2646  transposase, IS605 OrfB family  25.46 
 
 
419 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0234  transposase, IS605 OrfB family  27.38 
 
 
360 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  27.38 
 
 
360 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  27.38 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0632  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000767619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0171  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2228  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00238783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2274  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.118023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1854  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00011315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0162  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2358  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0658803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2331  transposase, IS605 OrfB family  24.94 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.11673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2240  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000297406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0530  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1921  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2095  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  27.08 
 
 
360 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0133  transposase  28.5 
 
 
409 aa  53.5  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0135  transposase, putative  28.5 
 
 
409 aa  53.5  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  27 
 
 
360 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  26.79 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  25.93 
 
 
370 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  30.11 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  26.79 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0427  IS605 family transposase OrfB  26.49 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2686  transposase  27.07 
 
 
372 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.442816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  30 
 
 
368 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  26.29 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1577  transposase, IS605 OrfB family  26.5 
 
 
396 aa  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.833624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  24.54 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3578  transposase, IS605 OrfB family  26.09 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  28.93 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1061  IS605 family transposase OrfB  26.82 
 
 
409 aa  47  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00139779  hitchhiker  0.000000305099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  29.27 
 
 
368 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1671  transposase, IS605 OrfB family  32.8 
 
 
405 aa  46.6  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  25.83 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1779  transposase, IS605 OrfB family  26.09 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  27.88 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4086  transposase, IS605 OrfB family  29.23 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1692  transposase  26.87 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153302  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  27.27 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  33.91 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2065  transposase, IS1341 family  28.1 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1239  transposase, IS605 OrfB family  28.91 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1128  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1561  transposase, IS605 OrfB family  29.41 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3228  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2646  transposase, IS605 OrfB family  30.4 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.866499  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  30 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  27.81 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2633  transposase, IS605 OrfB family  31.76 
 
 
372 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.56671  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0597  transposase, IS605 OrfB family  35.71 
 
 
374 aa  43.5  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000997644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  28.95 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  28.95 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0152  IS605 family transposase OrfB  27.74 
 
 
402 aa  43.1  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0917796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>