19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2911 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2911  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  472  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.603232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6246  hypothetical protein  27.83 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 597 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30539  predicted protein  30.16 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0319771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  25.45 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  25.76 
 
 		 467 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07051  hypothetical protein  31.09 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  26.27 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0873  hypothetical protein  26.02 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  24.67 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1770  hypothetical protein  26.5 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.679199  normal  0.0353666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  23.03 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  24.74 
 
 		 535 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  28.18 
 
 		 467 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 480 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  26.37 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0490  hypothetical protein  26.7 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1927  hypothetical protein  25.79 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>