24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4006 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  40.96 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  40.96 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  34.57 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  38.55 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  36.05 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  38.75 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  39.44 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  42.31 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  35.56 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  39.51 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  40.74 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  40.74 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1032  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  34.67 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  33.75 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1126  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  30.77 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  34.18 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  36.11 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2285  type IV pilus assembly PilZ  33.9 
 
 		 146 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>