217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2929 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1092    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  68.43 
 
 
457 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  65.27 
 
 
477 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  68.64 
 
 
464 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  89.02 
 
 
524 aa  978    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  89.21 
 
 
524 aa  980    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  68.78 
 
 
464 aa  681    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  89.4 
 
 
524 aa  979    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  53.28 
 
 
466 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  52.22 
 
 
457 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  51.77 
 
 
458 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  52.01 
 
 
459 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  54.04 
 
 
458 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.89 
 
 
467 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  51.87 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  50.34 
 
 
458 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  50.56 
 
 
458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  49.78 
 
 
458 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.27 
 
 
464 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  48.96 
 
 
466 aa  438  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  47.81 
 
 
465 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  47.34 
 
 
457 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  49.54 
 
 
458 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.11 
 
 
462 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.5 
 
 
464 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.73 
 
 
464 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  48.04 
 
 
464 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.27 
 
 
464 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  47.34 
 
 
464 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  47.34 
 
 
464 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  47.11 
 
 
464 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  48.36 
 
 
428 aa  418  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.04 
 
 
462 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.88 
 
 
457 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  41.38 
 
 
470 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  41.38 
 
 
470 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  41.15 
 
 
470 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  41.15 
 
 
470 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.71 
 
 
463 aa  333  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.91 
 
 
475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  40.77 
 
 
475 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  40.98 
 
 
475 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  40.75 
 
 
475 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  40.75 
 
 
475 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  40.31 
 
 
471 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  40.75 
 
 
475 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  40.38 
 
 
473 aa  323  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  39.87 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  40.52 
 
 
475 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  40.14 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  40.75 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  40.75 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  40.18 
 
 
473 aa  320  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  40.6 
 
 
472 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 
479 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  38.37 
 
 
480 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  40.89 
 
 
476 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  40.28 
 
 
475 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  39.66 
 
 
482 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  38.75 
 
 
473 aa  318  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  39.95 
 
 
473 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  39.95 
 
 
473 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
477 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  39.68 
 
 
464 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  40.26 
 
 
477 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  39.67 
 
 
475 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  38.94 
 
 
470 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  40.82 
 
 
476 aa  316  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  40.84 
 
 
477 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  40.84 
 
 
477 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  39.73 
 
 
473 aa  316  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  39.73 
 
 
473 aa  316  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  39.73 
 
 
473 aa  316  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  39.73 
 
 
473 aa  316  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  39.73 
 
 
473 aa  316  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  39.73 
 
 
473 aa  316  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  40.18 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  39.73 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  40.67 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  37.58 
 
 
501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 
485 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  40.13 
 
 
489 aa  312  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  40.45 
 
 
478 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2430  protein of unknown function DUF162  39.01 
 
 
481 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  39.32 
 
 
482 aa  309  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  40.09 
 
 
474 aa  309  8e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
479 aa  309  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  36.91 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  40.27 
 
 
481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  39.33 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  38.51 
 
 
490 aa  307  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  38.51 
 
 
469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  38.55 
 
 
473 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  38.31 
 
 
478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  40.28 
 
 
477 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  38.85 
 
 
486 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  38.95 
 
 
472 aa  302  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  36.89 
 
 
467 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>