96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2004 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2004  UreE urease accessory domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.761322  normal  0.0598469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0944  UreE urease accessory domain-containing protein  68.92 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0900984  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0882  UreE urease accessory domain protein  69.39 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.219178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  58.67 
 
 		 215 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4907  UreE urease accessory domain protein  64.43 
 
 		 185 aa  161  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.047168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  46.54 
 
 		 163 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1093  UreE urease accessory domain protein  45.77 
 
 		 169 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2865  UreE urease accessory domain-containing protein  47.89 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  42.25 
 
 		 169 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  42.25 
 
 		 163 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3240  UreE urease accessory domain protein  42.03 
 
 		 163 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1948  urease accessory protein UreE  35.71 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0304  urease accessory protein UreE  35.71 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  40.82 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  40.67 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  36.23 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  41.94 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  38 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  35.23 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  32.18 
 
 		 173 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4180  UreE urease accessory domain protein  38.3 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  40.32 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  39.33 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0336  urease accessory protein UreE  34.31 
 
 		 170 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  34.78 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7007  urease accessory protein UreE  40.32 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  36.18 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  34.78 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  38.61 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  38.61 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  38.61 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  34.57 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  36.61 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3048  UreE urease accessory domain protein  31.06 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.447079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  37.5 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0271  urease accessory protein UreE  32.85 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.591299  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0285  urease accessory protein UreE  32.85 
 
 		 171 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.735349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  38.13 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  38.53 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  39.72 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  36 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  36.08 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  39.74 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  39.74 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  32.24 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  35.1 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  39.1 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  39.1 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  39.1 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0990  urease accessory protein UreE  33.33 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  36.54 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  35.78 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  34.46 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  35.78 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  26.95 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  26.61 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1071  urease accessory protein UreE  36.52 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  27.11 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  37.93 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3470  urease accessory protein  33.68 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  33.15 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2992  UreE urease accessory domain-containing protein  32.37 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.520718  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29771  hypothetical protein  36.07 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  30.3 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  32.28 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  36.61 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  28.12 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2879  UreE urease accessory-like  32.63 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  30.99 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  28.89 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3940  urease accessory protein UreE  38.05 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19221  urease accessory protein UreE  30.48 
 
 		 146 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.447195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2304  UreE urease accessory-like protein  34.31 
 
 		 166 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1028  UreE urease accessory domain-containing protein  30.69 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0973  urease accessory protein UreE  29.89 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  25.81 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  32.37 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  41.18 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  25 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0957  urease accessory protein UreE  28.37 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  29.86 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3304  UreE urease accessory domain protein  36.81 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  52.63 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  31.45 
 
 		 168 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1426  UreE urease accessory, N-terminal:UreE urease accessory, C-terminal  35.16 
 
 		 175 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2253  urease accessory protein UreE  37 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  28.95 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  25.2 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  30.53 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  24.31 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  33.72 
 
 		 168 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03729  1,3-beta-D-glucan synthase catalytic subunitPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92225]  30.14 
 
 		 1905 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.789919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3105  urease accessory protein UreE  34 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  28.78 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1051  urease accessory protein E  28.57 
 
 		 146 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  30.53 
 
 		 167 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>