38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1007 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  221  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  44.79 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  46.81 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  45.65 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  45.33 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  45.33 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  49.25 
 
 
82 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  49.25 
 
 
82 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  39.71 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  38.36 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  46.67 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  37.04 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  43.75 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  43.84 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  37.68 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  35.48 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  29.9 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  42.55 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  34.25 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  51.52 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  48.72 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  48.78 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  51.52 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  40.43 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  33.82 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  45.24 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  40.43 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  40.43 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  36.78 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  47.37 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  53.12 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  51.52 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  29.21 
 
 
96 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>