41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3128 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  100 
 
 		 64 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  73.77 
 
 		 64 aa  93.2  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  67.21 
 
 		 71 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  67.21 
 
 		 61 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  67.21 
 
 		 64 aa  88.2  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  54.1 
 
 		 65 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0601  YcfA family protein  67.92 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4922  YcfA family protein  58.49 
 
 		 56 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.012764  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  55.74 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  55.56 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  55.74 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  53.33 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  55 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  49.18 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  46.67 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  46.67 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  47.54 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  51.72 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  45.9 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  48.33 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  50 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  48.33 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  48.33 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  44.83 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  42.11 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  44.83 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  43.33 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  44.26 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  55.56 
 
 		 54 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2607  YcfA family protein  46.77 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487609  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  37.7 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  45 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  40 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  43.1 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  41.67 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  38.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  41.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  36.84 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  38.33 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>