174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2973 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2973  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
558 aa  1085    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2855  glucan biosynthesis protein G  86.56 
 
 
558 aa  907    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3081  glucan biosynthesis protein G  85.48 
 
 
558 aa  929    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188456  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3903  glucan biosynthesis protein D  62.03 
 
 
504 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  42.19 
 
 
514 aa  335  9e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  41.27 
 
 
559 aa  329  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  40.74 
 
 
540 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  41.88 
 
 
498 aa  324  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  40.43 
 
 
545 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  40.85 
 
 
495 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  38.08 
 
 
522 aa  322  8e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  40.88 
 
 
529 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  41.43 
 
 
527 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  41.6 
 
 
498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  40.84 
 
 
522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 
588 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.44 
 
 
533 aa  319  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  38.99 
 
 
545 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  39.11 
 
 
545 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.99 
 
 
545 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  40.57 
 
 
544 aa  317  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  41.14 
 
 
530 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  40.78 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  41.14 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  41.19 
 
 
541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  38.36 
 
 
542 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  38.36 
 
 
542 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.47 
 
 
498 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  38.36 
 
 
542 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  38.36 
 
 
542 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  43.86 
 
 
542 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  42.28 
 
 
514 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  42.69 
 
 
532 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
525 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  35.94 
 
 
543 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  39.51 
 
 
533 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  40.9 
 
 
528 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  40.56 
 
 
519 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  38.3 
 
 
503 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  37.73 
 
 
525 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  37.53 
 
 
525 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  40.85 
 
 
517 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  36.46 
 
 
522 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  36.86 
 
 
522 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  35.17 
 
 
546 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  38.58 
 
 
511 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  39.77 
 
 
503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  33.63 
 
 
568 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  36.46 
 
 
522 aa  290  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  35.37 
 
 
517 aa  289  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  37.81 
 
 
534 aa  290  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  35.37 
 
 
511 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  35.37 
 
 
517 aa  289  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  35.37 
 
 
511 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  35.37 
 
 
517 aa  289  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  35.37 
 
 
511 aa  289  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  35.37 
 
 
511 aa  289  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  35.37 
 
 
511 aa  289  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  35.37 
 
 
511 aa  289  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  35.53 
 
 
594 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  36.21 
 
 
597 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  37.22 
 
 
534 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  39.09 
 
 
527 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  36.02 
 
 
604 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  36.02 
 
 
558 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  41.67 
 
 
545 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  38.05 
 
 
505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  35.83 
 
 
604 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  35.91 
 
 
534 aa  286  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  34.47 
 
 
517 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  34.47 
 
 
517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  34.47 
 
 
517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  34.47 
 
 
517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 
562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 
562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  35.69 
 
 
522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 
608 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 
562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  34.47 
 
 
517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  34.4 
 
 
528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  35.34 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  34.04 
 
 
511 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  40.56 
 
 
539 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  40.48 
 
 
539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  37.68 
 
 
519 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
508 aa  282  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  35.86 
 
 
530 aa  282  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  35.69 
 
 
527 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  35.48 
 
 
529 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  35.33 
 
 
529 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  38.9 
 
 
540 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  38.8 
 
 
527 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  38.68 
 
 
545 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  39.36 
 
 
531 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 
587 aa  278  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  36.9 
 
 
551 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  35.28 
 
 
531 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  34.62 
 
 
529 aa  277  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  38.71 
 
 
560 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  35.26 
 
 
534 aa  276  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>