35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0863 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 227 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  84.36 
 
 		 243 aa  390  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  84.77 
 
 		 243 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  74.86 
 
 		 227 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  59.8 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  62.24 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  45.31 
 
 		 192 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  39.46 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  42.05 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  41.27 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  39.2 
 
 		 195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  40.5 
 
 		 195 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  40.96 
 
 		 192 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  42.51 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  42.07 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  42.46 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  40.56 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  36.54 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  41.95 
 
 		 203 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  41.95 
 
 		 203 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  41.14 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  41.61 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  34.95 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  31.72 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  33.74 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  35.37 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  33.95 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  27.46 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  34.59 
 
 		 438 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  30.63 
 
 		 436 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  37.38 
 
 		 478 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  37.38 
 
 		 478 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  37.38 
 
 		 478 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.54 
 
 		 442 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>