26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2397 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  288  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  95.3 
 
 
149 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  92.62 
 
 
149 aa  216  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  65.38 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  60.67 
 
 
148 aa  167  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  59.06 
 
 
148 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  57.72 
 
 
148 aa  164  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  57.72 
 
 
148 aa  164  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  59.06 
 
 
148 aa  159  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  63.03 
 
 
152 aa  157  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  76.92 
 
 
148 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  65.74 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  65.81 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  52.67 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  44.72 
 
 
138 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  48.28 
 
 
143 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  45.97 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  51.3 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  36.8 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  32.85 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  34.91 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  34.91 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  27.73 
 
 
134 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  30.93 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>