36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1102 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  290  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  67.39 
 
 
161 aa  188  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  55.78 
 
 
168 aa  165  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  55.03 
 
 
152 aa  156  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  53.06 
 
 
153 aa  154  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  53.74 
 
 
148 aa  153  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  53.74 
 
 
148 aa  153  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  53.42 
 
 
152 aa  152  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  53.74 
 
 
153 aa  149  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.509127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  53.74 
 
 
148 aa  147  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  49.66 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  46.53 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  46.53 
 
 
177 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  47.55 
 
 
164 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  48.61 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  44.44 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  48.97 
 
 
178 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  47.22 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  47.22 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  47.22 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  47.18 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  47.22 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  46.53 
 
 
155 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  46.53 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  46.53 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  46.53 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  46.53 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  39.86 
 
 
163 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  46.53 
 
 
177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  46.53 
 
 
177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  40.56 
 
 
151 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  40.56 
 
 
151 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  45.83 
 
 
192 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  31.76 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  31.08 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>