37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1010 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  287  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  50.69 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  49.35 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  44.67 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  46.2 
 
 
161 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  46.05 
 
 
171 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  47.71 
 
 
161 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  44.37 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  47.02 
 
 
161 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  45.39 
 
 
161 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  44.12 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  44.12 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  44.12 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  32.41 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  33.77 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  31.03 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4254  hypothetical protein  46.04 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  39.16 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2062  hypothetical protein  48.67 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000914602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  34.9 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  32.39 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  34.09 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1189  hypothetical protein  33.09 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  29.2 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  34.44 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  29.87 
 
 
162 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  34.72 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  32.09 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  25.66 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1881  hypothetical protein  42.68 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575492 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  24.8 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  29.92 
 
 
161 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0448  protein of unknown function DUF456  30.41 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0986569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  34.56 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  26.39 
 
 
154 aa  43.9  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  25.48 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  27.59 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>