22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1686 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
158 aa  288  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4044  protein of unknown function DUF456  48.68 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0664  hypothetical protein  38.57 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27270  Protein of unknown function (DUF456)  42.65 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  42.34 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  43.07 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  42.34 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1532  hypothetical protein  42.66 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0624636  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  39.04 
 
 
166 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16000  Protein of unknown function (DUF456)  39.19 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148783  normal  0.0914905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0737  hypothetical protein  43.36 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0112  hypothetical protein  41.14 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2960  hypothetical protein  43.45 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19890  hypothetical protein  37.78 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.649353  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0722  hypothetical protein  42.76 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3772  protein of unknown function DUF456  33.56 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1497  hypothetical protein  41.53 
 
 
220 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28240  hypothetical protein  42.54 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2540  protein of unknown function DUF456  38.52 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.658317  normal  0.52211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  37.29 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  34.56 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1189  hypothetical protein  32.14 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>