19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27270 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27270  Protein of unknown function (DUF456)  100 
 
 
170 aa  317  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  43.98 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3772  protein of unknown function DUF456  44.08 
 
 
167 aa  104  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19890  hypothetical protein  41.38 
 
 
165 aa  99  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.649353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  42.65 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  37.59 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  37.59 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  37.59 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4044  protein of unknown function DUF456  41.01 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0664  hypothetical protein  35.81 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1532  hypothetical protein  43.7 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0624636  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16000  Protein of unknown function (DUF456)  39.55 
 
 
166 aa  72  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148783  normal  0.0914905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2960  hypothetical protein  42.86 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0737  hypothetical protein  37.76 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0722  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0112  hypothetical protein  37.34 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1497  hypothetical protein  38.05 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4908  hypothetical protein  39.18 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.417496  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28240  hypothetical protein  40.62 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>