15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1811 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  44.32 
 
 
276 aa  191  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  47.09 
 
 
344 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  44.25 
 
 
349 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  38.97 
 
 
682 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  40.17 
 
 
848 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  34.69 
 
 
653 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  34.05 
 
 
1732 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  39.08 
 
 
787 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  34.8 
 
 
2554 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  36.57 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  38.57 
 
 
670 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  41.3 
 
 
3295 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  36.99 
 
 
361 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  29.15 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>