29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1379 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  67.8 
 
 
177 aa  273  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  65.34 
 
 
182 aa  259  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  36.05 
 
 
168 aa  122  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  38.24 
 
 
170 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  38.85 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  33.54 
 
 
168 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  31.79 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  35.98 
 
 
174 aa  84.7  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  33.94 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  30.38 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.82 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  28.19 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  27.54 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.25 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  24.67 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  24.67 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.56 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  31.33 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  28.44 
 
 
189 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  26.81 
 
 
160 aa  45.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  27.01 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  32.95 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.45 
 
 
160 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  26.61 
 
 
189 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.43 
 
 
189 aa  41.6  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.28 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  24.52 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>