17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0604 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  100 
 
 		 126 aa  258  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  57.14 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  53.04 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  41.6 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  41.13 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  38.84 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  38.4 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  41.88 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  37.5 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  37.7 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  34.75 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  26.4 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  33.88 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  24.19 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  24.81 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>