32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0539 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  100 
 
 		 87 aa  177  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1969  50S ribosomal protein L31e  81.61 
 
 		 87 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  75.86 
 
 		 88 aa  140  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  73.56 
 
 		 87 aa  137  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  70.11 
 
 		 87 aa  133  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0114  50S ribosomal protein L31e  57.65 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0458  50S ribosomal protein L31e  61.9 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.76449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1568  ribosomal protein L31e  49.38 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  59.26 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  58.02 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  56.79 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  55.56 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  56.16 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0027  Ribosomal protein L31e  46.84 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0999  50S ribosomal protein L31e  41.57 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1233  Ribosomal protein L31e  44.71 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.547002  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1819  Ribosomal protein L31e  45.83 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.802601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0234  Ribosomal protein L31e  45.83 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1825  50S ribosomal protein L31e  45.57 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.957131 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0827  50S ribosomal protein L31e  41.38 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00216714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  41.56 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  42.86 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0457  50S ribosomal protein L31e  42.86 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  40.24 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  41.89 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0201  ribosomal protein L31e  40 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.802964  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10681  60S ribosomal protein L31e (AFU_orthologue; AFUA_6G13250)  46.3 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06820  PRCDNA87, putative  43.75 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00995827  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27125  predicted protein  37.04 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736977  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83357  60S large subunit ribosomal protein  37.5 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17087  Ribosomal protein L31, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.89 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106125  hitchhiker  0.0023739 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1324  LSU ribosomal protein L31E (rpl31E)  33.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.646557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>